Galaxy


Qu’est-ce que Galaxy ?

Galaxy est une plateforme web dédiée à l'analyse de données biologiques. Son interface graphique permet de réaliser et de reproduire des analyses de façon intuitive, par “clique-bouton”.

Galaxy permet également d’automatiser les traitements de données à l’aide de workflows et de conserver l’historique des analyses.

Plus d’informations : voir www.galaxyproject.org


Comment accéder à l’instance Galaxy bilille ?

L'instance Galaxy bilille est hébergée sur le cloud bilille. Elle propose des outils de base pour l’analyse de données, telles que données de séquençage ou données d’expression. Pour y accéder, vous devez disposer d’un compte sur le cloud bilille: voir les instructions pour l'ouverture d'un compte.

Il manque un outil qui vous serait utile, et qui est disponible sur le toolshed de Galaxy ? Vous pouvez faire une demande d’ajout par mail, en précisant le nom exact de l'outil et la publication qui le décrit. Nous verrons s’il est possible de l’intégrer à l’instance bilille.


Formations

La plateforme organise de manière régulière des journées d’initiation à l’utilisation de Galaxy. Le calendrier est disponible ici. Si vous souhaitez être tenu au courant des prochaines dates, envoyez-nous un mail.


Documentation

Permanences

La plateforme assure des séances de permanence ouvertes et hebdomadaires, pour répondre en direct à vos questions.

  • 1er et 3ème jeudi du mois, de 9h à 12h: Université Lille 1, Cité Scientifique, bureau bilille (bâtiment M3 ext, 230)   plan d'accès
  • 2ème et 4ème jeudi du mois, de 14h à 17h: Université Lille 2, Pôle recherche de la Faculté de médecine, bureau bilille (rez-de chaussée près de la salle des conseils) plan d'accès

Attention : il n'y aura pas de permanences Galaxy pendant l'été. Reprise des permanences le 7 Septembre.


Contact

Samuel Blanck et Isabelle Guigon (mails)