Galaxy
Qu’est-ce que Galaxy ?
Galaxy est une plateforme web dédiée à l'analyse de données biologiques. Son interface graphique permet de réaliser et de reproduire des analyses de façon intuitive, par “clique-bouton”.
Galaxy permet également d’automatiser les traitements de données à l’aide de workflows et de conserver l’historique des analyses.
Plus d’informations : voir www.galaxyproject.org
Comment accéder à l’instance Galaxy bilille ?
L'instance Galaxy bilille est hébergée sur le cloud bilille. Elle propose des outils de base pour l’analyse de données, telles que données de séquençage ou données d’expression. Pour y accéder, vous devez disposer d’un compte sur le cloud bilille: voir les instructions pour l'ouverture d'un compte.
Il manque un outil qui vous serait utile, et qui est disponible sur le toolshed de Galaxy ? Vous pouvez faire une demande d’ajout par mail, en précisant le nom exact de l'outil et la publication qui le décrit. Nous verrons s’il est possible de l’intégrer à l’instance bilille.
Formations
La plateforme organise de manière régulière des journées d’initiation à l’utilisation de Galaxy. Le calendrier est disponible ici. Si vous souhaitez être tenu au courant des prochaines dates, envoyez-nous un mail.
Documentation
Permanences
La plateforme assure des séances de permanence hebdomadaires, pour répondre en direct à vos questions: lieux et planning
Contact
Samuel Blanck et Isabelle Guigon (mails)